抗菌、抗感染天然药物及其产业技术研究，主要涉及中药与天然药物、功能性食品、医疗器械和卫生用品等行业领域。

先后在国内外学术刊物上发表学术论文共40余篇，出版专著2部，近5年来发表的论文如下：
1.Qing-Ying Luo, Hong-Fu Cao, Shu-Kun Liu, Min Wu, Shan-Shan Li, Zhi-Qing Zhang, An-Jun Chen, Guang-Hui Shen, He-Jun Wu, Mei-Liang Li, Xing-Yan Liu, Yong Jiang, Jun-Fei Bi & Zheng-You He (2020) Novel liquid fermentation medium of Cordyceps militaris and optimization of hydrothermal reflux extraction of cordycepin, Journal of Asian Natural Products Research, 22:2, 167-178, DOI: 10.1080/10286020.2018.1539080
2.Zhengyou He, M. Lan, D. Lu, H. Zhao and H. Yuan, "Antioxidant Activity of 50 Traditional Chinese Medicinal Materials Varies with Total Phenolics," Chinese Medicine, Vol. 4 No. 4, 2013, pp. 148-156. doi: 10.4236/cm.2013.44018.
3.高鑫,王安琪,何正有,毕建军,蒋用,李佳,汤秀强.黑曲霉转化穿山龙皂苷制备prosapogenin B工艺的探究[J].中成药,2021,43(07):1819-1822.
4.何正有,罗璞,高鑫,蒋用,毕建军,汤秀强.中药天然产物抗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)研究进展[J].国外医药(抗生素分册),2020,41(04):274-282.DOI:10.13461/j.cnki.wna.005320.
5.高鑫,何正有,罗璞,蒋用,毕建军,汤秀强.抗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)中药复方中高频单味药的研究概述[J].国外医药(抗生素分册),2020,41(04):283-289.DOI:10.13461/j.cnki.wna.005321.
6.许凌巧,王安琪,何正有,蒋用,李佳,毕建军.提高人参茎叶皂苷中稀有人参皂苷含量的工艺[J].食品工业,2020,41(02):50-53.
7.王安琪,崔杰,刘海侠,何正有.积雪草皂苷微生物转化研究[J].中国抗生素杂志,2018,43(11):1371-1375.DOI:10.13461/j.cnki.cja.006426.
8.崔杰,何正有,毕建军,蒋用,刘海侠,李佳,刘宏璧,李思奇.荣保灵芝1号多糖的分离纯化与化学结构初步研究[J].食品科技,2018,43(04):205-211.DOI:10.13684/j.cnki.spkj.2018.04.038.
9.崔杰,何正有,屠银芳,刘婧,王安琪.莼菜多糖的分离、纯化及结构初步研究[J].中成药,2018,40(04):990-993.
10.屠银芳,何正有,刘婧,姚洁,李维,邹昆,崔杰.HPLC同时测定莼菜多糖及其胶囊中的分子量和含量[J].华西药学杂志,2017,32(03):291-293.DOI:10.13375/j.cnki.wcjps.2017.03.023.

参与国家级重大科技攻关项目3项、上海市科技公关项目4项；负责四川省科技厅项目3项、市局级项目3项、企业攻关项目20余项；在研项目9项；获四川省科技进步三等奖2项、成都市科技进步二等奖2项；申请国家发明专利25项，授权发明专利15项，部分授权专利如下：
1.一种灵芝多糖、灵芝三萜酸及氨基酸的同步提取纯化方法,CN201910469255
2.一种灵芝总三萜组合物及其制备方法,CN201510421407
3.香菇多糖及其提取纯化方法,CN201510365038
4.含莼菜的复方皮肤外用制剂及制备方法和应用,CN201510364929
5.莼菜精华水,CN201510340907
6.6莼菜面膜液,CN20151033616
7.高抗人源肿瘤细胞活性的灵芝总三萜纯化物及其纯化方法,CN201410551800
8.一种高银杏萜类内酯含量的银杏达莫注射液的制备方法,CN201210178017
9.一种高纯度灯盏花素乙素的制备方法,CN200910263574