1、抗生素类（头孢类、氨基糖苷类药物的开发，部分项目已实现产业化）、抗肿瘤类（秋水仙碱衍生物及新型Akt激酶抑制剂）等生理活性分子的设计、合成及工艺研发工作。2、有机化学均相催化及杂原子 Si、B 化合物对不饱和键的化学选择性还原等基础研究工作。3、生物大分子（核酸、蛋白质）的化学选择性修饰和生物正交反应。4、医用临床病理诊断技术及设备的开发。

1. Liwen Liu, Yu Liu, Xue Shen, Xiao Zhang, Shengqi Deng, Yang Chen*, The Journal of Organic Chemistry, 2022, 87, 6321-6329. (IF=3.6)
2. Liwen Liu, Qianwen Wang, Yu Liu, Xiao Zhang, Da Lu, Shengqi Deng, Yihua Gao, Yang Chen*, Tetrahedron Letters, 2020, 61, 151702. (IF=2.1)
3. Yang Chen, Haibin Song, Chunming Cui*, Angewandte Chemie, International Edition. 2010, 49, 8958-8961. (IF=16.9)
4. Yang Chen*, Lixin Yang, Yu Liu, Shengqi Deng, ChemistrySelect 2018, 3, 96-99. (IF=2.0)
5. Yang Chen*, Lixin Yang, Yu Liu, Shengqi Deng, ChemistrySelect 2018, 3, 12325-12329. (IF=2.0)
6. Xuefeng Yang, Ping Xu, Qiuchen Liu, Yu Liu, Yang Chen*, ChemistrySelect 2025, 10, in press, DOI: 10.1002/slct.202505323 (IF=2.0)

纵向项目：
1.：四川省科技计划应用基础研究项目，2019YJ0284，主持。
2.抗生素研究与再评价四川省重点实验室开放基金，编号：ARRLKF18-04，主持。
3.四川省教育厅科研项目，编号：18ZB0134，主持。
4.成都东部新区天府锦城实验室（未来医学城）揭榜挂帅项目，主研。
横向项目：
1.阿米卡星新工艺及新型氨基糖苷类抗生素的研发。2.注射用头孢雷特制剂的药学研发。3.抗感染药物-头孢类及氨基糖苷类
授权专利：
1.《依替米星衍生物及其制备方法、其药物组合物和应用》，ZL 201810025265.5，中国发明专利，授权。
2.《氨基糖苷类衍生物及其制备方法和应用》，ZL 201711401335.4，中国发明专利，授权。
3. 《一种使用“一锅法”标记修饰生物大分子的方法》，ZL 201510527391.7，中国发明专利，授权。
4. LEAD COMPOUND SYNTHESIS AND SCREENING METHOD AND KIT, PCT/CN2013/089875, WO 2014/094621。
5. METHOD FOR SOLID-PHASE SYNTHESIS OF DNA-ENCODED CHEMICAL LIBRARY, PCT/CN2016/079171, WO 2016/165621